Управление образовательной организацией осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Структурных подразделений нет.
Органами коллегиального управления являются:
• Общее собрание работников (п. 3.7. Устава МБОУ "Кугесьский лицей")
• Педагогический совет (п. 3.8. Устава МБОУ "Кугесьский лицей")
• Управляющий совет (п. 3.9. Устава МБОУ "Кугесьский лицей")
Положения о коллегиальных органах управления Уставом школы не предусмотрены.
Место нахождения органов управления совпадает с юридическим и фактическим адресом образовательной организации.